36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4695 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4695  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5160  hypothetical protein  96.48 
 
 		 198 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5238  hypothetical protein  82.76 
 
 		 201 aa  286  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5879  hypothetical protein  59.31 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6496  hypothetical protein  50.99 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5431  hypothetical protein  49.28 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1435  hypothetical protein  42.48 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1827  hypothetical protein  44.44 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2569  hypothetical protein  69.12 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2578  hypothetical protein  69.12 
 
 		 267 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  decreased coverage  0.0015233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2893  hypothetical protein  51.96 
 
 		 276 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2852  hypothetical protein  67.65 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3946  hypothetical protein  71.88 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3005  hypothetical protein  42.6 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4236  hypothetical protein  60.61 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333237  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1474  hypothetical protein  47.13 
 
 		 294 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.656718  normal  0.108211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1673  hypothetical protein  47.13 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2684  hypothetical protein  55.22 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2149  hypothetical protein  37.95 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1570  hypothetical protein  34.56 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139907  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1782  hypothetical protein  35.57 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0939  hypothetical protein  50.75 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0946  hypothetical protein  50.75 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2242  hypothetical protein  48.57 
 
 		 259 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1150  hypothetical protein  52.24 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.775258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1724  hypothetical protein  48.05 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0136792 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1004  hypothetical protein  31.19 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1797  hypothetical protein  47.37 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1689  hypothetical protein  44.78 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2263  hypothetical protein  29.23 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0185  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1095  hypothetical protein  57.89 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0686  hypothetical protein  22.34 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000452039  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0653  hypothetical protein  22.34 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000874284  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0824  hypothetical protein  41.03 
 
 		 242 aa  41.6  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1021  hypothetical protein  41.03 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.204635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>