22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3527 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  59.29 
 
 
168 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  55.4 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  45.16 
 
 
161 aa  120  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  39.42 
 
 
145 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  34.03 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  36.69 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  35 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  32.17 
 
 
146 aa  87.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  37.29 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  35.71 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  36.43 
 
 
211 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  39.37 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  34.07 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  34.04 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  34.31 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  30.82 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  27.69 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  32.97 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  31.53 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>