37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1587 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 		 362 aa  750    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  78.45 
 
 		 362 aa  609  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  77.65 
 
 		 365 aa  598  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  75.69 
 
 		 362 aa  600  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  74.85 
 
 		 340 aa  548  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  66.48 
 
 		 373 aa  518  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  62.88 
 
 		 369 aa  495  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.81 
 
 		 364 aa  488  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.41 
 
 		 366 aa  490  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.66 
 
 		 362 aa  484  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  67.81 
 
 		 357 aa  487  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  62.85 
 
 		 370 aa  482  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  62.82 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.25 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  38.7 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  39.55 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  39.88 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  39.3 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  39 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  35.52 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  33.14 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  32.4 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  32.63 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  30 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  31.72 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  29.23 
 
 		 367 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  28.96 
 
 		 367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  28.65 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  30.92 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  31.42 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  30.71 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.13 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  30.37 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  27.25 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  26.01 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  24.18 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  26.18 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>