13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0863 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0863  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  57.72 
 
 
154 aa  173  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  55.56 
 
 
149 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  50.76 
 
 
152 aa  148  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  46.1 
 
 
165 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  41.89 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  47.1 
 
 
172 aa  130  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  41.1 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  38.35 
 
 
189 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  36.91 
 
 
203 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46817  predicted protein  32.71 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410977  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  30.82 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  31.75 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>