19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2212 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  98.91 
 
 
92 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1827  hypothetical protein  85.26 
 
 
95 aa  157  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  53.16 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  51.65 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  50.59 
 
 
87 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7049  hypothetical protein  48.24 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0979561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0032  hypothetical protein  49.41 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0234  hypothetical protein  41.25 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  48.15 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0176  hypothetical protein  42.5 
 
 
84 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  45.57 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  41.25 
 
 
85 aa  67  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4119  hypothetical protein  43.53 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  42.17 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  45.12 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  39.29 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2294  hypothetical protein  26.37 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00328626  hitchhiker  0.00199724 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5414  hypothetical protein  38.82 
 
 
89 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>