20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1578 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  364  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.942269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0304  hypothetical protein  93.05 
 
 		 187 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4382  hypothetical protein  92.31 
 
 		 247 aa  270  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3758  hypothetical protein  81.38 
 
 		 188 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0157129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3832  hypothetical protein  92.23 
 
 		 103 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4880  hypothetical protein  75 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3833  hypothetical protein  84.29 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3519  hypothetical protein  41.78 
 
 		 235 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8184  hypothetical protein  44.68 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3549  hypothetical protein  67.9 
 
 		 81 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3548  hypothetical protein  77.78 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4984  hypothetical protein  47.41 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4114  hypothetical protein  41.03 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.649728  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1689  hypothetical protein  35.93 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.198075  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1415  hypothetical protein  35.14 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  0.264539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4879  hypothetical protein  85.37 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0354  hypothetical protein  40.82 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1411  hypothetical protein  36.77 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.116883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2664  hypothetical protein  33.1 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208467  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0449  hypothetical protein  31.65 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.597223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>