54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0740 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  100 
 
 
205 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  99.51 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  95.12 
 
 
205 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  77.34 
 
 
208 aa  328  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  69 
 
 
208 aa  287  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  67.5 
 
 
207 aa  284  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  66 
 
 
205 aa  280  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  67.33 
 
 
205 aa  274  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  68 
 
 
207 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  55.84 
 
 
205 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  53.09 
 
 
208 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  52.58 
 
 
208 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  52.06 
 
 
208 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  52.06 
 
 
208 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  52.58 
 
 
208 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  52.58 
 
 
208 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  52.06 
 
 
208 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  53.81 
 
 
205 aa  201  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  50.52 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  50.52 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  50.52 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  50.52 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  50.52 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  50.52 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  50.52 
 
 
443 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  49.48 
 
 
208 aa  197  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  44 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  43.88 
 
 
218 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  40.72 
 
 
199 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  41.71 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  38.02 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  37.63 
 
 
217 aa  131  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  38.42 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  34.34 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  34.54 
 
 
228 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  34.02 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  29.29 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  27.92 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  26.9 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  26.9 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  26.81 
 
 
380 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  26.38 
 
 
380 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  26.38 
 
 
380 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  26.38 
 
 
380 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  26.38 
 
 
380 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  26.38 
 
 
380 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  27.12 
 
 
380 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  26.38 
 
 
380 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  26.34 
 
 
378 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  26.75 
 
 
378 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  26.34 
 
 
378 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  25.21 
 
 
378 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93854  predicted protein  28.4 
 
 
340 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00630097  normal  0.0600499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  22.86 
 
 
305 aa  44.7  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>