37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1202 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 
373 aa  774    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  77.2 
 
 
369 aa  610  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  73.65 
 
 
357 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  66.48 
 
 
362 aa  518  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  64.9 
 
 
365 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.48 
 
 
364 aa  495  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.76 
 
 
362 aa  490  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.94 
 
 
366 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  62.88 
 
 
362 aa  490  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  62.22 
 
 
370 aa  485  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  65.87 
 
 
340 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  61.77 
 
 
362 aa  484  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  61.24 
 
 
361 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.65 
 
 
362 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  39.72 
 
 
365 aa  252  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  38.59 
 
 
363 aa  249  6e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  40.82 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  40.23 
 
 
365 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  40.23 
 
 
365 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  35.31 
 
 
370 aa  208  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  31.89 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  33.14 
 
 
367 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  31.78 
 
 
367 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  32.55 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  30.96 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  30.77 
 
 
369 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  31.07 
 
 
386 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  30.81 
 
 
367 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  30.23 
 
 
367 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  29.94 
 
 
367 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  29.33 
 
 
367 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  33.65 
 
 
389 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  28.41 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  28.39 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  23.67 
 
 
432 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  21.96 
 
 
559 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  27.34 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>