14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0433 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0296  hypothetical protein  54.24 
 
 
603 aa  662    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0433  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1231    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.430655  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1552  glycogen synthase  52.26 
 
 
594 aa  633  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.575386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  26.42 
 
 
1421 aa  89  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5697  Glycogen(starch) synthase  22.73 
 
 
606 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3735  Glycogen (starch) synthase  23.02 
 
 
604 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00590  glycogen (starch) synthase, putative  23 
 
 
733 aa  67  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  22.86 
 
 
1413 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1581  glycogen synthase, glycosyltransferase family 3 protein  28.89 
 
 
604 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0619337  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81231  glycogen (starch) synthase  33.87 
 
 
699 aa  50.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490915  normal  0.0297098 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08010  glycogen synthase (Eurofung)  34.33 
 
 
711 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53633  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  25.17 
 
 
400 aa  44.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  29.29 
 
 
395 aa  43.9  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.62 
 
 
489 aa  43.9  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>