39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0306 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0306  dihydropteroate synthase  100 
 
 
489 aa  971    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0190  hypothetical protein  54.18 
 
 
493 aa  549  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0717  dihydropteroate synthase-related protein  50.61 
 
 
482 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2712  dihydropteroate synthase DHPS  43.97 
 
 
471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0215  dihydropteroate synthase-related protein  43.93 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2402  dihydropteroate synthase  41.02 
 
 
471 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2299  dihydropteroate synthase-related protein  42.28 
 
 
474 aa  300  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1090  dihydropteroate synthase-related protein  34.1 
 
 
523 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0516227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  33.52 
 
 
530 aa  253  7e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1829  dihydropteroate synthase-related protein  32.95 
 
 
523 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0827  dihydropteroate synthase-related protein  32.12 
 
 
523 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376775  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0892  dihydropteroate synthase-related protein  33.65 
 
 
523 aa  248  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1673  hypothetical protein  36.23 
 
 
475 aa  247  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.293824  hitchhiker  0.0000000161519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0631  dihydropteroate synthase-related protein  34.13 
 
 
512 aa  183  7e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498786  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0222  dihydropteroate synthase-related protein  32.26 
 
 
498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1581  dihydropteroate synthase, DHPS  30.23 
 
 
481 aa  163  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00143208  unclonable  0.000000236622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2035  dihydropteroate synthase DHPS  28.31 
 
 
489 aa  163  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1793  dihydropteroate synthase DHPS  33.24 
 
 
524 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.425163  normal  0.963011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1245  pterin-binding domain-containing protein  28.89 
 
 
465 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1842  dihydropteroate synthase DHPS  32.95 
 
 
524 aa  154  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2177  dihydropteroate synthase DHPS  32.95 
 
 
524 aa  153  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339932  normal  0.330618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5321  dihydropteroate synthase DHPS  32.67 
 
 
471 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2394  dihydropteroate synthase DHPS  31.05 
 
 
464 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5017  dihydropteroate synthase DHPS  32.67 
 
 
471 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4100  dihydropteroate synthase DHPS  29.72 
 
 
472 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2616  pterin-binding domain-containing protein  28.64 
 
 
479 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.521784  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2725  dihydropteroate synthase DHPS  32.37 
 
 
520 aa  143  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63462  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2441  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein  31.4 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5941  dihydropteroate synthase DHPS  31.14 
 
 
461 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0197789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3075  dihydropteroate synthase DHPS  30.81 
 
 
495 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3143  dihydropteroate synthase DHPS  27.74 
 
 
471 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6492  dihydropteroate synthase DHPS  26.89 
 
 
462 aa  136  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  52.08 
 
 
380 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3193  hypothetical protein  33.09 
 
 
129 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0005  dihydropteroate synthase  38.75 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00021463  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  27.43 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  32.74 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0034  hypothetical protein  44.07 
 
 
127 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0582  hypothetical protein  46 
 
 
137 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.837008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>