23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3680 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1024    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  47.89 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  40.09 
 
 		 469 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  39.24 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  35.4 
 
 		 484 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  35.27 
 
 		 476 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  32.14 
 
 		 478 aa  261  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  34.22 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  32.42 
 
 		 501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  33.05 
 
 		 485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  31 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  30.63 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  28.16 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  28.79 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  26.54 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  23.24 
 
 		 460 aa  95.1  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  26.04 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  25.44 
 
 		 373 aa  76.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  28.08 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  23.56 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  24.5 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  27.21 
 
 		 548 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2300  hypothetical protein  30.53 
 
 		 727 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  0.6586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>