37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2806 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 
369 aa  764    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  77.2 
 
 
373 aa  610  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  70.09 
 
 
357 aa  521  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  63.33 
 
 
365 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  62.88 
 
 
362 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.2 
 
 
364 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62.92 
 
 
362 aa  484  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  63.87 
 
 
362 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  59.57 
 
 
370 aa  481  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.8 
 
 
366 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  62.36 
 
 
361 aa  481  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  64.07 
 
 
340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  59.28 
 
 
362 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.08 
 
 
362 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  39.15 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  39.55 
 
 
365 aa  249  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  40.24 
 
 
365 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  40.24 
 
 
365 aa  238  9e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  40.24 
 
 
365 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  35.36 
 
 
370 aa  216  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  33.43 
 
 
379 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  29.09 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  29.64 
 
 
367 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  29.64 
 
 
367 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  29.36 
 
 
367 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  33.14 
 
 
367 aa  170  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  32.85 
 
 
367 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  30.77 
 
 
369 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  32.85 
 
 
367 aa  168  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  31.58 
 
 
367 aa  166  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  32.53 
 
 
430 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  28.94 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.42 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  28.4 
 
 
339 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  23.84 
 
 
432 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  22.53 
 
 
559 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  24.59 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>