24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1929 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1036    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  47.89 
 
 
506 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  41.65 
 
 
469 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  40.31 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  40.22 
 
 
484 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  39.73 
 
 
476 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  36.03 
 
 
484 aa  289  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  35.23 
 
 
478 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  33.85 
 
 
501 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  33.18 
 
 
485 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  33.4 
 
 
493 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  28.51 
 
 
498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  31.75 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  31.29 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  27.71 
 
 
463 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  23.32 
 
 
460 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  26.7 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  23.05 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  25.61 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  25.71 
 
 
524 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  27.72 
 
 
432 aa  62  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  23.15 
 
 
649 aa  54.7  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1148  hypothetical protein  21.73 
 
 
408 aa  47.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.159501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1372  hypothetical protein  21.82 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.856108  normal  0.0265653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>