17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1676 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1676  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  844    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3328  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  37.09 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.703732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2104  hypothetical protein  38.5 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0344  hypothetical protein  35.18 
 
 		 417 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0687151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2369  hypothetical protein  32.58 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1035  hypothetical protein  31.31 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0444  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  37.26 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0477  hypothetical protein  28.61 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1978  hypothetical protein  27.32 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0514587  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2261  hypothetical protein  29.96 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2096  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  27.67 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.735031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2265  hypothetical protein  26.97 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0678841  normal  0.713238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02430  hypothetical protein  21.34 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0596996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1990  hypothetical protein  22.74 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00460  hypothetical protein  19.54 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  22.17 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>