22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0972 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0972  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  35.65 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  34.78 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  35.85 
 
 
118 aa  48.5  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  34.78 
 
 
114 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  34.78 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  29.84 
 
 
140 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  30 
 
 
115 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  32.17 
 
 
114 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  29.17 
 
 
116 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  26.56 
 
 
128 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  30.83 
 
 
114 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>