16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0128 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0128  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  350  7e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1262  hypothetical protein  61.18 
 
 
173 aa  223  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0701  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  42.21 
 
 
515 aa  120  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.187582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0935  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  41.03 
 
 
509 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1624  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  41.22 
 
 
524 aa  100  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.931737  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1064  hypothetical protein  35.8 
 
 
171 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.618696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1562  hypothetical protein  35.19 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.911918  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1148  GHMP kinase group 1  34.68 
 
 
519 aa  84  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.820316  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1697  hypothetical protein  34.78 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0349  hypothetical protein  35.19 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0595803  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1054  hypothetical protein  32.52 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3957  hypothetical protein  29.38 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5298  protein of unknown function DUF98  29.87 
 
 
223 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0556574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3289  hypothetical protein  31.87 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.677915 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3260  protein of unknown function DUF98  24.52 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3390  hypothetical protein  25.61 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.00000000204141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>