61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3610 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3610  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3158  rod shape-determining protein MreC, subtype  44.83 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2515  hypothetical protein  43 
 
 
198 aa  174  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188858  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1483  hypothetical protein  44.5 
 
 
198 aa  174  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1217  hypothetical protein  43.22 
 
 
198 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431766  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1620  hypothetical protein  44.5 
 
 
198 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00150531  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1597  hypothetical protein  44.5 
 
 
198 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.141069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2412  hypothetical protein  44.72 
 
 
198 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000204833  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2757  protein of unknown function DUF1282  44.5 
 
 
198 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.002843  normal  0.0623291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1586  hypothetical protein  44 
 
 
198 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000135398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2570  hypothetical protein  43 
 
 
198 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0732957  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2668  hypothetical protein  43 
 
 
198 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.127943  normal  0.189722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2614  hypothetical protein  43.72 
 
 
198 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2688  hypothetical protein  42 
 
 
198 aa  168  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000021601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2502  hypothetical protein  42.5 
 
 
198 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019326  normal  0.0107231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1534  hypothetical protein  43 
 
 
198 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.113804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4189  hypothetical protein  46.77 
 
 
199 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1787  hypothetical protein  43 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49050  hypothetical protein  45.77 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00210087  hitchhiker  0.0000000540119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2964  hypothetical protein  44.28 
 
 
199 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177485  normal  0.0208011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3797  hypothetical protein  41.09 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.532295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3120  hypothetical protein  40.2 
 
 
198 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148578  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33240  hypothetical protein  44.78 
 
 
199 aa  158  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0765852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1202  hypothetical protein  43.28 
 
 
199 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1610  hypothetical protein  42.79 
 
 
199 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1242  hypothetical protein  42.29 
 
 
199 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000574212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1640  hypothetical protein  41.79 
 
 
199 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4077  hypothetical protein  41.79 
 
 
199 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.974663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01961  hypothetical protein  39.6 
 
 
199 aa  148  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000520439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4233  hypothetical protein  40.59 
 
 
209 aa  147  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2965  hypothetical protein  32.99 
 
 
220 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal  0.0742439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2361  hypothetical protein  33.67 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63262  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2407  inner membrane protein YohC  34.72 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100146  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2314  inner membrane protein YohC  34.72 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.691053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2358  inner membrane protein YohC  34.72 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2403  hypothetical protein  34.72 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3980  hypothetical protein  32.99 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238019  normal  0.279719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2515  inner membrane protein YohC  34.2 
 
 
195 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0909  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334035  normal  0.242601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1512  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1522  protein of unknown function DUF1282  36.27 
 
 
195 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2425  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2270  hypothetical protein  36.27 
 
 
195 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3261  hypothetical protein  36.27 
 
 
203 aa  124  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0836  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  124  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2735  hypothetical protein  34.36 
 
 
195 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02023  hypothetical protein  35.75 
 
 
195 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02065  predicted inner membrane protein  35.75 
 
 
195 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2391  hypothetical protein  34.02 
 
 
200 aa  121  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2547  hypothetical protein  35 
 
 
204 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0148102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2694  hypothetical protein  37.82 
 
 
203 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1777  hypothetical protein  35.59 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1885  hypothetical protein  35.59 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2549  hypothetical protein  35.59 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1363  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3224  hypothetical protein  32.74 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.067185 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1097  hypothetical protein  28.99 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36410  hypothetical protein  24.34 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433568  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3124  hypothetical protein  24.34 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3567  hypothetical protein  27.21 
 
 
408 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.129707  normal  0.931427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2890  protein of unknown function DUF1282  27.21 
 
 
408 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>