71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1573 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1573  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
116 aa  238  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25770  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  81.58 
 
 
118 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.961132  normal  0.553234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1635  type IV pilus assembly PilZ  80.7 
 
 
118 aa  201  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2201  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  81.58 
 
 
118 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1653  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  80 
 
 
117 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4150  Type IV pilus assembly PilZ  79.28 
 
 
118 aa  191  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440208  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1654  Type IV pilus assembly PilZ  76.32 
 
 
118 aa  190  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  0.307598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3825  type IV pilus biogenesis protein PilZ  77.48 
 
 
118 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14990  type IV pilus assembly protein  70.8 
 
 
118 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1414  type IV pilus assembly PilZ  68.47 
 
 
120 aa  168  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.152869  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1994  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  68.75 
 
 
118 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1827  type IV pilus assembly PilZ  68.47 
 
 
113 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1658  Type IV pilus assembly PilZ  65.45 
 
 
123 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0211682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0879  type IV pilus assembly PilZ  65.18 
 
 
117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1541  type IV pilus assembly protein PilZ  60.36 
 
 
123 aa  150  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0811165  normal  0.123076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02715  type IV fimbriae assembly protein  63.39 
 
 
114 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2195  Type IV pilus assembly PilZ  57.66 
 
 
120 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.609234 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1639  type IV fimbriae assembly protein  60.36 
 
 
117 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1582  type IV fimbriae assembly protein  60.36 
 
 
117 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0574097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2501  type IV pilus assembly PilZ  56.25 
 
 
121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.313407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1498  type IV pilus assembly PilZ  55.86 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133421  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3390  type IV pilus assembly PilZ  52.25 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0381125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3410  type IV pilus assembly PilZ  49.14 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.595597  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1985  type IV pilus assembly PilZ  47.01 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1719  type IV pilus assembly PilZ  47.01 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.137522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2856  type IV pilus assembly PilZ  50.45 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2517  type IV pilus assembly PilZ  49.55 
 
 
126 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.179103  hitchhiker  0.00950119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2257  type IV pilus assembly PilZ  47.75 
 
 
120 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1144  type IV pilus assembly PilZ  53.7 
 
 
113 aa  120  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1007  type IV pilus assembly PilZ  47.75 
 
 
122 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1858  type IV pilus assembly protein  46.43 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.595679 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1251  type IV pilus assembly PilZ  56.76 
 
 
112 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1786  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  51.33 
 
 
129 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0774026  normal  0.113647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1423  type IV pilus assembly PilZ  50 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1950  type IV pilus assembly PilZ  46.9 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.700098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1464  type IV pilus assembly PilZ  50.89 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634618  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1880  type IV pilus assembly PilZ  45.95 
 
 
126 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0639562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1608  type IV pilus assembly PilZ  46.67 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0391991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1436  Type IV pilus assembly PilZ  46.09 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1352  hypothetical protein  46.73 
 
 
118 aa  103  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1356  hypothetical protein  46.73 
 
 
118 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1826  type IV pilus assembly PilZ  42.24 
 
 
136 aa  103  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0117521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1066  type IV pilus assembly PilZ  41.44 
 
 
115 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0651699  normal  0.921742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2304  putative type IV pilus biogenesis protein pilZ  45.26 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1312  type IV fimbriae assembly protein  39.64 
 
 
115 aa  87  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.826043  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2238  type IV pilus biogenesis protein pilZ  41.05 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1984  type IV pilus assembly PilZ  42.11 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.748677  normal  0.0111146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2646  type IV pilus assembly PilZ  42.11 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.109453 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2049  type IV pilus assembly PilZ  38.95 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1581  type IV pilus assembly PilZ  41.05 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.875524  normal  0.520302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1925  type IV pilus biogenesis protein PilZ  36.19 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1590  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0382259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1915  type IV pilus assembly protein PilZ, putative  33.33 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2041  type IV pilus biogenesis protein pilZ  37.89 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1738  type IV pilus biogenesis protein pilZ  37.89 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254841  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1768  type IV pilus biogenesis protein pilZ  36.84 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598238  normal  0.61176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1663  type IV pilus biogenesis protein pilZ  36.84 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2611  type IV pilus biogenesis protein pilZ  36.84 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2212  type IV pilus biogenesis protein PilZ  36.84 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2457  type IV pilus biogenesis protein PilZ  36.84 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0645818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1894  type IV pilus biogenesis protein PilZ  36.84 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0727827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2570  type IV pilus biogenesis protein PilZ  36.84 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.207839  normal  0.0806474 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2450  type IV pilus biogenesis protein PilZ  36.84 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0971788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  36.49 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  31.96 
 
 
843 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3472  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 
121 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3408  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 
121 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3501  type IV pilus assembly PilZ  32.22 
 
 
185 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.424652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>