9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0008 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0135973  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0041  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0235767  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.921424  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.129572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56031  normal  0.0314068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>