39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1013 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 
363 aa  746    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  81.67 
 
 
365 aa  629  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  82.42 
 
 
365 aa  618  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  82.71 
 
 
365 aa  618  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  82.13 
 
 
365 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.06 
 
 
364 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  38.7 
 
 
362 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  39.55 
 
 
370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.17 
 
 
362 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  38.7 
 
 
361 aa  257  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  39.09 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  39.28 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  39.15 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  38.31 
 
 
362 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  37.57 
 
 
362 aa  250  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  38.59 
 
 
373 aa  249  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  39.43 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  40.3 
 
 
340 aa  242  9e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  35.97 
 
 
379 aa  229  5e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  36.57 
 
 
367 aa  219  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  38.24 
 
 
367 aa  218  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  34.83 
 
 
369 aa  216  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  37.96 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  33.15 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  35.98 
 
 
367 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  34.62 
 
 
367 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  34.62 
 
 
367 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  34.34 
 
 
367 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  33.62 
 
 
386 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  35.64 
 
 
370 aa  186  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  31.97 
 
 
430 aa  186  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.37 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  35.09 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27014  predicted protein  25.34 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0279403  normal  0.0136943 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  25.26 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  21.28 
 
 
559 aa  53.5  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  27.19 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  30.99 
 
 
882 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>