27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1845 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2871  hypothetical protein  46.81 
 
 		 1044 aa  907    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2382  virulence protein SrfB  44.93 
 
 		 995 aa  867    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0470  virulence protein SrfB  45.45 
 
 		 1000 aa  892    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2094  virulence protein SrfB  45.27 
 
 		 995 aa  867    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125719  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2101  virulence protein SrfB  44.19 
 
 		 996 aa  837    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1881  virulence protein SrfB  44.93 
 
 		 995 aa  859    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0611287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52090  hypothetical protein  55.36 
 
 		 992 aa  1118    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1747  virulence protein SrfB  42.7 
 
 		 993 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.841748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1566  virulence protein SrfB  42.7 
 
 		 993 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.823683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1712  virulence protein SrfB  42.5 
 
 		 993 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1774  virulence protein SrfB  42.7 
 
 		 993 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.513722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1709  virulence protein SrfB  42.6 
 
 		 993 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2281  SrfB superfamily virulence factor  42.64 
 
 		 987 aa  781    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1434  virulence protein SrfB  45.24 
 
 		 981 aa  853    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1843  putative virulence factor SrfB  43.93 
 
 		 1023 aa  821    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2109  virulence protein SrfB  41.27 
 
 		 993 aa  767    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4239  virulence protein SrfB  45.65 
 
 		 1000 aa  889    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2632  virulence protein SrfB  46.91 
 
 		 1044 aa  907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.623195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1845  hypothetical protein  100 
 
 		 996 aa  2029    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3154  hypothetical protein  37.32 
 
 		 993 aa  589  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.30642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1313  virulence factor SrfB-like protein  37.01 
 
 		 1036 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1964  virulence protein SrfB  34.21 
 
 		 1042 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4052  hypothetical protein  34.03 
 
 		 1020 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0348037  normal  0.215609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0897  virulence protein SrfB  33.3 
 
 		 1041 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.112933  normal  0.362744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3216  virulence factor SrfB-like protein  34.55 
 
 		 996 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.952482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6482  virulence protein SrfB  30.73 
 
 		 1048 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1953  putative virulence factor SrfB  46.3 
 
 		 383 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>