21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02631 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02631  putative lipoprotein  100 
 
 
427 aa  891    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1631  hypothetical protein  45.83 
 
 
431 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.332695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2145  pectinacetylesterase putative  26.88 
 
 
339 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0583729  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1456  putative esterase  28.22 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.243415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0548  putative lipoprotein  27.01 
 
 
377 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0335  putative lipoprotein  27.53 
 
 
359 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.484636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1006  hypothetical protein  26.3 
 
 
462 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0348  hypothetical protein  29.72 
 
 
465 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1893  hypothetical protein  29.72 
 
 
461 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1230  hypothetical protein  29.72 
 
 
461 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1221  hypothetical protein  29.72 
 
 
465 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0802  hypothetical protein  29.72 
 
 
461 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1065  hypothetical protein  29.72 
 
 
461 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.185724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1375  hypothetical protein  29.72 
 
 
461 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2665  hypothetical protein  26.56 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3005  hypothetical protein  29.11 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23455  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2411  hypothetical protein  28.96 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  0.0792191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2331  hypothetical protein  29.07 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4076  hypothetical protein  25.15 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167257  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2451  putative lipoprotein  25.57 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29431  predicted protein  21.97 
 
 
496 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.386445  normal  0.32597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>