50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01340 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  86.28 
 
 		 226 aa  387  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  48.89 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  44.49 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  44.84 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  45.98 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  44.84 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  44 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  44 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  42.6 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  41.52 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  36.12 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  36.16 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  38.39 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  37.5 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  37.5 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  37.5 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  37.5 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  37.5 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  37.95 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  37.5 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  37.5 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  37.05 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  37.05 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  36.16 
 
 		 229 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  34.67 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  37.05 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  36.61 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  35.71 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  36 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  35.71 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  35.68 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  33.93 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  36.28 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  36.28 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  36.28 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  36.28 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  36.28 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  36.28 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  36.96 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  35.84 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  34.96 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  34.96 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  34.96 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  34.96 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  29.82 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  27.68 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  24.66 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  24.22 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  25.56 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>