28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4226 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4226  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4736  hypothetical protein  80.19 
 
 
206 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00217507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0095  hypothetical protein  48.76 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2240  hypothetical protein  46.77 
 
 
216 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732493  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2283  hypothetical protein  48.26 
 
 
218 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  0.0451993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2558  hypothetical protein  48.26 
 
 
218 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.971372  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5619  hypothetical protein  34.72 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4561  hypothetical protein  27.96 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1494  hypothetical protein  32.31 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1575  hypothetical protein  31.5 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4736  hypothetical protein  29.92 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.935032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1514  hypothetical protein  32 
 
 
236 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1598  hypothetical protein  31.85 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1118  hypothetical protein  31.85 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2483  hypothetical protein  34.88 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1639  hypothetical protein  31.2 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1601  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0876  hypothetical protein  27.08 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.423577  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0038  hypothetical protein  25.74 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177426  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0803  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0358  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.240886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1701  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1214  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0931852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1842  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4161  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.720268  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3017  hypothetical protein  34.02 
 
 
165 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal  0.0643153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1857  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2011  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>