17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4000 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4000  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2764  hypothetical protein  75 
 
 		 76 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563488  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0651  hypothetical protein  68.92 
 
 		 74 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7046  transposase  67.57 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9093  hypothetical protein  67.57 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0689  hypothetical protein  67.57 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3406  hypothetical protein  67.57 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1790  preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)  59.21 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.896296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3515  hypothetical protein  58.67 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780841  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4100  hypothetical protein  54.05 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2155  preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)  59.46 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0962171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3434  hypothetical protein  58.11 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3115  ISPpu13, transposase Orf3  50 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.542239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3984  ISPpu13, transposase Orf3  50 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4505  ISPpu13, transposase Orf3  44.44 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0199  hypothetical protein  64.29 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000213611  unclonable  0.0000000000580335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>