28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1702 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  79.18 
 
 
272 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  61.41 
 
 
267 aa  321  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  65.98 
 
 
271 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  42.17 
 
 
259 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  38.08 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  39.17 
 
 
287 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  37.45 
 
 
311 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  39.17 
 
 
304 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  39.81 
 
 
286 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  34.2 
 
 
264 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  36.77 
 
 
241 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  24.62 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  32.11 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  25.57 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  36.09 
 
 
200 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  29.37 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  29.17 
 
 
366 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  29.53 
 
 
272 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  28.47 
 
 
299 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  25.84 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  27.33 
 
 
185 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  28.31 
 
 
194 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  26.57 
 
 
183 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  26.57 
 
 
183 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  24.7 
 
 
191 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  23.78 
 
 
189 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>