51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0738 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  71.33 
 
 		 457 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  902    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  51.12 
 
 		 364 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  51.68 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  49.3 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  48.75 
 
 		 360 aa  309  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  47.21 
 
 		 364 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  46.93 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  47.75 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  45.58 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  48.86 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  44.28 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  43.99 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  44.31 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  40.44 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  43.3 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  37.74 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  41.85 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  42.46 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  43.79 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  43.5 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  40.11 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  38.87 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  37.82 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  38.34 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  33.24 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  28.06 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  32.77 
 
 		 401 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  35.88 
 
 		 355 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  26.92 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  31.32 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  33.24 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  33.96 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  28.29 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0973  hypothetical protein  58.96 
 
 		 136 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  31.21 
 
 		 337 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1482  hypothetical protein  44.32 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  36.96 
 
 		 133 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  37.63 
 
 		 133 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4741  peroxidase  24.62 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198593  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  30.77 
 
 		 329 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  32.47 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  25.22 
 
 		 566 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  32.47 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  23.31 
 
 		 707 aa  43.5  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  25.52 
 
 		 331 aa  43.5  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>