55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1867 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.625381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1867  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2252  hypothetical protein  41.87 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3021  hypothetical protein  43.15 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.214048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2753  hypothetical protein  43.07 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3242  hypothetical protein  41.58 
 
 		 214 aa  130  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2463  hypothetical protein  37.26 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0245  hypothetical protein  33.5 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1008  hypothetical protein  39.11 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02357  hypothetical protein  40.11 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1661  hypothetical protein  34.85 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2786  hypothetical protein  36.27 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00487472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0200  hypothetical protein  38.22 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0273  hypothetical protein  36.73 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.172532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1726  hypothetical protein  34.39 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1935  hypothetical protein  34.43 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0577  hypothetical protein  38.15 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0126  hypothetical protein  38.15 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0609  hypothetical protein  38.15 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0534  hypothetical protein  37.79 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0510  hypothetical protein  37.79 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1191  hypothetical protein  32.35 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2776  hypothetical protein  38.15 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.584619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3691  hypothetical protein  37.79 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3444  hypothetical protein  35.53 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3070  hypothetical protein  32.09 
 
 		 188 aa  92.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0323  hypothetical protein  41.48 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2862  hypothetical protein  32.56 
 
 		 229 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3941  hypothetical protein  34.44 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000387144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3061  hypothetical protein  37.41 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2498  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168198  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1278  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3500  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.591854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3286  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0419  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3462  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3497  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2626  hypothetical protein  34.21 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2617  hypothetical protein  37.12 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3423  hypothetical protein  38.6 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172088  normal  0.0352219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3203  hypothetical protein  31.19 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.95995  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3027  hypothetical protein  36.36 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3983  hypothetical protein  32.8 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000946307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1492  hypothetical protein  42.24 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1166  hypothetical protein  34.81 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0855  hypothetical protein  40.83 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.942711  normal  0.0675477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3394  hypothetical protein  32.16 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.843919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3641  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2951  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1097  hypothetical protein  28.64 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0275723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2783  hypothetical protein  35.65 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0947  hypothetical protein  30.61 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3355  hypothetical protein  34.45 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>