12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1283 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1283  hypothetical protein  100 
 
 		 1421 aa  2908    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000525148 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4333  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1444 aa  345  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1092  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1431 aa  343  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0637  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1448 aa  221  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1374  hypothetical protein  31.56 
 
 		 1459 aa  219  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.153977  normal  0.0344633 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3497  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1425 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4013  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1485 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2395  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1432 aa  162  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1811  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1339 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.455816  normal  0.488445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0672  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1124 aa  59.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0505  transposase  27.75 
 
 		 639 aa  55.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.804069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1013  hypothetical protein  21 
 
 		 1314 aa  55.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>