19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0674 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0674  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0513  hypothetical protein  98.53 
 
 
68 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  58.51 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  53.66 
 
 
104 aa  93.6  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  58.97 
 
 
84 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  47.06 
 
 
74 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  39.24 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  39.73 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  35.44 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  31.08 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  38.16 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  30.56 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0896  hypothetical protein  29.41 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89715  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0906  hypothetical protein  37.66 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.866498  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  31.08 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  27.4 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1819  hypothetical protein  22.67 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  29.63 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>