12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4249 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4249  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5255  hypothetical protein  55.77 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5805  hypothetical protein  58.18 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3807  hypothetical protein  47.46 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0772852  hitchhiker  0.00532281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5920  hypothetical protein  71.88 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0917  hypothetical protein  53.06 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3573  hypothetical protein  51.02 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4794  hypothetical protein  51.02 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4711  hypothetical protein  64.1 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414183  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5977  hypothetical protein  52.73 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.355962  normal  0.578827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0945  hypothetical protein  44.74 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2933  hypothetical protein  44.12 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0190325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>