18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4187 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4187  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.431269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0398  hypothetical protein  33.7 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4557  hypothetical protein  36.31 
 
 		 197 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5363  hypothetical protein  33.52 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5271  hypothetical protein  32.97 
 
 		 175 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5413  hypothetical protein  33.13 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911887  normal  0.141138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5142  hypothetical protein  32.61 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2072  hypothetical protein  30.67 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04350  hypothetical protein  31.14 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5529  hypothetical protein  31.87 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5078  hypothetical protein  31.87 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1100  hypothetical protein  28.32 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0956  hypothetical protein  28.32 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.104469  normal  0.977999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3569  hypothetical protein  30.57 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5664  hypothetical protein  29.41 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.821811  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0524  hypothetical protein  28.48 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4186  hypothetical protein  45.1 
 
 		 122 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4429  hypothetical protein  31.37 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>