16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2616 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2616  fimbrial assembly  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  37.02 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  42.4 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  35.36 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  42.16 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4709  hypothetical protein  30.34 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  42.16 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3881  hypothetical protein  35.04 
 
 		 452 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2306  hypothetical protein  35.64 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256089  normal  0.206542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29130  hypothetical protein  41.05 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  33.64 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1297  transmembrane protein  35.63 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2586  transmembrane protein  27.27 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02974  hypothetical protein  32.56 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  30.23 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  30.11 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>