19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2243 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2243  Mu-like prophage major head subunit gpT  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3001  major head subunit protein  42.95 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1607  Mu-like prophage major head subunit gpT  41.28 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1304  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  41.28 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2096  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  41.28 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4497  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  39.93 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1637  hypothetical protein  37.54 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2144  prophage MuSo1, major head subunit, putative  37.83 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2098  prophage MuSo1, major head subunit, putative  37.83 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.168211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0675  prophage MuSo1, major head subunit, putative  37.83 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3356  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  39.39 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1882  Mu-like prophage major head subunit  41.79 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2685  prophage MuSo2, major head subunit, putative  37.67 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0735  hypothetical protein  37.54 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0755  major head subunit  36.82 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0682  major head subunit  36.82 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0095  hypothetical protein  36.15 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131989  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  38.71 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0952  Mu-like protein prophage major head subunit gpT-like protein  24.83 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>