66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0452 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0452  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1747  hypothetical protein  55 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2358  protein of unknown function DUF336  51.88 
 
 		 172 aa  170  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.61424  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29320  hypothetical protein  55.7 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1996  hypothetical protein  50.34 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1459  hypothetical protein  48.12 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1480  hypothetical protein  48.12 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1674  hypothetical protein  48.75 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2653  hypothetical protein  47.53 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1814  hypothetical protein  53.06 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0773  hypothetical protein  53.06 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0389  hypothetical protein  53.06 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1246  hypothetical protein  53.06 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1731  hypothetical protein  53.06 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1983  hypothetical protein  53.06 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1831  hypothetical protein  53.06 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2506  hypothetical protein  53.06 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2914  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1558  hypothetical protein  46.88 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1534  hypothetical protein  46.88 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1078  hypothetical protein  46.88 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1660  hypothetical protein  48.75 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0922603  normal  0.0534906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2872  hypothetical protein  48.32 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4700  hypothetical protein  45.62 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2503  hypothetical protein  46.88 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1734  hypothetical protein  45.62 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1764  hypothetical protein  55.24 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1914  protein of unknown function DUF336  46.41 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.180095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1792  hypothetical protein  44.97 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1581  hypothetical protein  44.97 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1243  hypothetical protein  40.41 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0924995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003593  hypothetical protein  47.55 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5390  hypothetical protein  45.03 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05610  hypothetical protein  43.66 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237845  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4513  hypothetical protein  41.1 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0133  protein of unknown function DUF336  47.06 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2342  hypothetical protein  41.89 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1766  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.267084  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66044  predicted protein  37.14 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.148486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1397  hypothetical protein  40.58 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1852  hypothetical protein  41.38 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1411  hypothetical protein  38.12 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.851451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1419  hypothetical protein  40.58 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0937  hypothetical protein  40.58 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2291  protein of unknown function DUF336  41.09 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4062  hypothetical protein  40.28 
 
 		 155 aa  90.9  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.628231  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1367  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3426  hypothetical protein  34.78 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000510798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3413  hypothetical protein  32.41 
 
 		 206 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3104  hypothetical protein  32.61 
 
 		 216 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3413  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0245  protein of unknown function DUF336  36.96 
 
 		 155 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3401  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1896  hypothetical protein  36.96 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.935839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4563  hypothetical protein  39.13 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3106  hypothetical protein  31.03 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1338  hypothetical protein  38.36 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12350  hypothetical protein  38.85 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1299  hypothetical protein  38.13 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2865  protein of unknown function DUF336  33.81 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0168022 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02061  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04590)  36.88 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  31.08 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>