35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  100 
 
 
779 aa  1458    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  36.49 
 
 
790 aa  280  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  35.16 
 
 
789 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  32.08 
 
 
826 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  32.63 
 
 
834 aa  243  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  36.55 
 
 
758 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  33.33 
 
 
789 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  36.75 
 
 
857 aa  225  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  33.25 
 
 
758 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  34 
 
 
751 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  33.96 
 
 
752 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  32.67 
 
 
761 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  32.36 
 
 
759 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  32.58 
 
 
820 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  32.61 
 
 
756 aa  195  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  32.25 
 
 
739 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  32.25 
 
 
764 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  31.96 
 
 
764 aa  193  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  29.29 
 
 
822 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  35.22 
 
 
762 aa  188  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  33.25 
 
 
747 aa  187  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  31.08 
 
 
837 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  31.76 
 
 
777 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  35.47 
 
 
953 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  31.62 
 
 
820 aa  184  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  31.05 
 
 
748 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  31.06 
 
 
751 aa  164  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  32.02 
 
 
719 aa  162  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  37.67 
 
 
745 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  30.72 
 
 
876 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  30.88 
 
 
726 aa  144  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  31.75 
 
 
798 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  29.43 
 
 
840 aa  124  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  44.94 
 
 
817 aa  101  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  27.74 
 
 
856 aa  94.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>