20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20020 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  157  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  42.5 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  41.46 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  39.29 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  37.8 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1833  thiamineS protein  43.28 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  41.03 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  38.46 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  41.03 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  41.03 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  40.24 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  40.96 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  42.68 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  35.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  37.8 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  35.29 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  44.05 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  33.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  33.75 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.52 
 
 		 217 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>