12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17200  Cutinase  100 
 
 		 423 aa  831    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1514  cutinase  32.19 
 
 		 235 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0692058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0988  cutinase  23.86 
 
 		 292 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1006  cutinase  23.86 
 
 		 292 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1016  cutinase  23.86 
 
 		 292 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13836  hypothetical protein  25.4 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1283  cutinase  25 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00904546  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1519  cutinase  37.23 
 
 		 216 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00723296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1515  cutinase  27.81 
 
 		 514 aa  46.6  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0339808  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2670  NLP/P60 protein  26.44 
 
 		 818 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5074  cutinase  28.87 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.527565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4874  hypothetical protein  28.18 
 
 		 626 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>