14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15100 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15100  T5orf172 domain-containing protein  100 
 
 
71 aa  142  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.177671  normal  0.7549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3313  conserved hypothetical cytosolic protein  50 
 
 
398 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15600  hypothetical protein  43.75 
 
 
394 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000896111  unclonable  6.48725e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2528  hypothetical protein  43.75 
 
 
403 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  hitchhiker  0.000213496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5331  putative cytoplasmic protein  45.31 
 
 
389 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1284  YeeC-like protein  41.79 
 
 
397 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0761  hypothetical protein  39.39 
 
 
398 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0739979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3048  YeeC-like protein  42.19 
 
 
392 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1752  YeeC-like protein  40.91 
 
 
391 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870079  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4501  hypothetical protein  43.75 
 
 
409 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0854244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1467  hypothetical protein  36.36 
 
 
444 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0265  hypothetical protein  37.5 
 
 
391 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.77928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3041  hypothetical protein  30.88 
 
 
419 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0030  hypothetical protein  30.3 
 
 
446 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>