12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06890  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  454  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1132  hypothetical protein  33.67 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0602  ABC transporter protein  30.61 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0978  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377564  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1855  hypothetical protein  32.83 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.076354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4167  hypothetical protein  32.68 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4448  putative integral membrane protein  33.67 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.440749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0451  hypothetical protein  32.26 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4275  hypothetical protein  34.62 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.273706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3787  hypothetical protein  32.22 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3974  hypothetical protein  28.65 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0800365  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 319 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>