11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1795 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1795  rhodopsin  100 
 
 		 312 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3652  rhodopsin  51.54 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.212812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2966  rhodopsin  32.92 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1643  rhodopsin  26.69 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6515  rhodopsin  27.64 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02160  hypothetical protein  23.89 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0315  rhodopsin  29.24 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0839724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2680  rhodopsin  29.74 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0085  rhodopsin  31.02 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3441  rhodopsin  27.44 
 
 		 233 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000429167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0448  rhodopsin  28.18 
 
 		 238 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.937786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>