22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1665 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1665  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  328  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2977  flagellar biosynthesis protein FliO  31.41 
 
 
180 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2332  hypothetical protein  43.24 
 
 
318 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0856  hypothetical protein  31.67 
 
 
139 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0878754  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  35.9 
 
 
211 aa  48.5  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0963  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  47.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2017  flagella biosynthesis protein FliZ  40.91 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.29 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.56 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  32 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  35.23 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  35.29 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  31.78 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2012  hypothetical protein  29.95 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  33.77 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  35.53 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  37.66 
 
 
206 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.53 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.53 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  35.96 
 
 
224 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  38.16 
 
 
203 aa  41.2  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  45.28 
 
 
152 aa  41.2  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>