35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2048 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  100 
 
 
822 aa  1608    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  34.85 
 
 
953 aa  263  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  33.33 
 
 
817 aa  260  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  33.43 
 
 
790 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  34.41 
 
 
745 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  30.27 
 
 
751 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  29.54 
 
 
777 aa  213  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  32.81 
 
 
761 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  30.25 
 
 
752 aa  193  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  31.71 
 
 
789 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  30.67 
 
 
820 aa  188  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  30.71 
 
 
762 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  33.27 
 
 
857 aa  183  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  30 
 
 
820 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  29.4 
 
 
759 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  30.52 
 
 
758 aa  174  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  28.37 
 
 
837 aa  174  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  30.92 
 
 
748 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  29.91 
 
 
747 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  29.67 
 
 
779 aa  171  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  31.04 
 
 
789 aa  171  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  30.54 
 
 
751 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  31.35 
 
 
756 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  30.6 
 
 
764 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  30.86 
 
 
739 aa  163  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  30.5 
 
 
764 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  28.88 
 
 
826 aa  159  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  28.99 
 
 
834 aa  157  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  29.67 
 
 
758 aa  154  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  31.95 
 
 
876 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  26.73 
 
 
798 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  30.39 
 
 
726 aa  138  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  30.96 
 
 
840 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  28.94 
 
 
719 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  31.64 
 
 
856 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>