17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1904 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1904  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13050  VTC domain-containing protein  44.66 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1573  VTC domain protein  48.97 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.375137  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3226  hypothetical protein  46.86 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3221  hypothetical protein  44.94 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  40.17 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0852  hypothetical protein  43.65 
 
 		 277 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.538253  normal  0.0167402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3117  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0313259  normal  0.140705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3209  hypothetical protein  42.13 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03050  VTC domain-containing protein  42.06 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1332  hypothetical protein  40.94 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 735 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  34.43 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  32.41 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  31.76 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  29.75 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03580  VTC domain-containing protein  23.81 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>