21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1434 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1434  V-type ATP synthase subunit E  100 
 
 
207 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0278  V-type ATP synthase subunit E  59.16 
 
 
192 aa  201  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.591531 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3350  H+transporting two-sector ATPase E subunit  66.15 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1374  H+transporting two-sector ATPase E subunit  61.98 
 
 
193 aa  186  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1278  V-type ATP synthase subunit E  65.62 
 
 
194 aa  185  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1240  V-type ATP synthase subunit E  33.51 
 
 
183 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1612  V-type ATP synthase subunit E  32.8 
 
 
182 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.923493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0389  V-type ATP synthase subunit E  31.22 
 
 
183 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1180  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  28.12 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0119921  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0284  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  27.98 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1219  hypothetical protein  30.37 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000580099  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2680  H+transporting two-sector ATPase E subunit  26.56 
 
 
191 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0166336  normal  0.115798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1692  H+transporting two-sector ATPase E subunit  28.8 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0855  H+transporting two-sector ATPase E subunit  28.28 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2348  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  27.98 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.23341 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1265  H+transporting two-sector ATPase E subunit  27.04 
 
 
194 aa  48.1  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_7408  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  26.76 
 
 
216 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161915  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1450  H+transporting two-sector ATPase E subunit  30.98 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0325956  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19410  V-type ATP synthase subunit E  27.08 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1689  H+transporting two-sector ATPase E subunit  25.64 
 
 
183 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0706  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  26.32 
 
 
190 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0351771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>