37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0129 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  81.89 
 
 		 364 aa  637    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  84.59 
 
 		 366 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 		 370 aa  759    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  83.06 
 
 		 362 aa  631  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  80.5 
 
 		 361 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  62.22 
 
 		 373 aa  485  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  59.57 
 
 		 369 aa  481  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  62.85 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  59.5 
 
 		 365 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  58.66 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  59.5 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  60.95 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  61.34 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.49 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  40.11 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  41.11 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  39.55 
 
 		 363 aa  259  6e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  40.52 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  40.23 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  36.39 
 
 		 370 aa  233  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  31.45 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  32.45 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  31.13 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  30.85 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  32.6 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  31.13 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  33.53 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  30.58 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  33.24 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  33.53 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0732584 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  33.15 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  32.94 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  29.91 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  27.44 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  23.81 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  23.75 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  24.41 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>