9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2852 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2852    100 
 
 
1271 bp  2520    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  83.33 
 
 
1224 bp  63.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  97.14 
 
 
1260 bp  61.9  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3051  transposase, IS605 OrfB family  84.15 
 
 
1299 bp  60  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3284    84.15 
 
 
171 bp  60  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0315896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1261    84.72 
 
 
888 bp  56  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0939273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2347    94.12 
 
 
1298 bp  52  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2680  transposase, IS605 OrfB family  91.89 
 
 
1242 bp  50.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430379  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3846    93.75 
 
 
228 bp  48.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.134225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>