20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4076 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4076  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  905    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167257  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2411  hypothetical protein  39.78 
 
 
467 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  0.0792191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2331  hypothetical protein  41.21 
 
 
405 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1006  hypothetical protein  32.68 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3005  hypothetical protein  32.78 
 
 
458 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23455  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1375  hypothetical protein  32.68 
 
 
461 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0348  hypothetical protein  32.68 
 
 
465 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1221  hypothetical protein  32.68 
 
 
465 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0802  hypothetical protein  32.68 
 
 
461 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1230  hypothetical protein  32.68 
 
 
461 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1065  hypothetical protein  32.68 
 
 
461 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.185724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1893  hypothetical protein  32.68 
 
 
461 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2665  hypothetical protein  32.06 
 
 
374 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0335  putative lipoprotein  31.42 
 
 
359 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.484636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1631  hypothetical protein  26.48 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.332695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2145  pectinacetylesterase putative  26.18 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0583729  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1456  putative esterase  25.8 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.243415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02631  putative lipoprotein  25.15 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2451  putative lipoprotein  26.18 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0548  putative lipoprotein  27.75 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>