13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2886 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2886  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0860  hypothetical protein  97.15 
 
 
246 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0670  hypothetical protein  95.93 
 
 
246 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.996768  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2813  hypothetical protein  94.72 
 
 
378 aa  475  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528989  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0916  hypothetical protein  95.88 
 
 
162 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0973  hypothetical protein  97.18 
 
 
71 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0917  hypothetical protein  91.8 
 
 
59 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0586  hypothetical protein  94.23 
 
 
100 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0786  hypothetical protein  92.59 
 
 
54 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2855  hypothetical protein  65.62 
 
 
72 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221021  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0787  hypothetical protein  93.02 
 
 
43 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1554  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0962  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.33 
 
 
285 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.56065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>