18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1330 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1330  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  755    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3074  hypothetical protein  40.41 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.340992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0907  hypothetical protein  36.19 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0733644  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1318  hypothetical protein  34.64 
 
 		 337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.889926  normal  0.0248237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0600  hypothetical protein  35.77 
 
 		 371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2915  hypothetical protein  35.29 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0838  hypothetical protein  32.17 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.23349  normal  0.0364981 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1706  HAD superfamily hydrolase  31.69 
 
 		 303 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1705  hypothetical protein  31.8 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1707  DNA repair and recombination protein RadA  33.23 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1489  hypothetical protein  32.02 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.627679 
 
 
-
 
NC_002936  DET1386  hypothetical protein  29.76 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000644457  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0594  hypothetical protein  25.61 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0041  hypothetical protein  26.71 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4146  hypothetical protein  31.6 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2655  hypothetical protein  32.43 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0703  hypothetical protein  33.14 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4009  hypothetical protein  26.92 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>